Przejdź do treści

Podsumowanie kursu

Tłumaczenie wspomagane przez AI - dowiedz się więcej i zasugeruj ulepszenia

Gratulacje ukończenia kursu Scale with Seqera! 🎉

Twoja droga

Zacząłeś od rejestracji na Seqera Platform i eksploracji Community Showcase, następnie uruchomiłeś pipeline produkcyjny, nf-core/rnaseq, z poziomu interfejsu webowego i monitorowałeś jego wykonanie. Potem uwierzytelniłeś CLI tw i nauczyłeś się robić wszystko z poziomu terminala. Na koniec zarejestrowałeś nowy pipeline, nf-core/demo, z GitHub i uruchomiłeś go zarówno z interfejsu webowego, jak i z CLI.

Czego się nauczyłeś

Potrafisz już uruchamiać i monitorować pipeline'y Nextflow na Seqera Platform, niezależnie od tego, czy wolisz interfejs webowy, czy wiersz poleceń.

  • Darmowe konto Seqera daje Ci osobistą przestrzeń roboczą i dostęp do Community Showcase.
  • Pipeline'y dodane do przestrzeni roboczej pojawiają się w Launchpadzie i można je uruchomić kilkoma kliknięciami.
  • CLI tw oferuje te same możliwości co interfejs webowy — przydatne przy skryptowaniu i automatyzacji.
  • Każdy pipeline hostowany na GitHub, zawierający pliki main.nf i nextflow.config, można zarejestrować przy użyciu tw pipelines add.
  • tw launch przyjmuje parametry przez profile i --params-file, a nie przez pojedyncze flagi.

Zdobyte umiejętności

W trakcie tego praktycznego kursu nauczyłeś się:

  • Rejestrować się na Seqera Platform i eksplorować Community Showcase
  • Dodawać pipeline do przestrzeni roboczej i uruchamiać go z interfejsu webowego
  • Monitorować wykonanie oraz sprawdzać szczegóły i raporty na poziomie zadań
  • Uwierzytelniać się i używać CLI tw do zarządzania pipeline'ami i ich uruchamiania z terminala
  • Rejestrować pipeline hostowany na GitHub i uruchamiać go z plikiem parametrów

Jesteś teraz gotowy do uruchamiania i monitorowania własnych pipeline'ów na Seqera Platform, na dużą skalę.

Kolejne kroki

Oto nasze najważniejsze sugestie dotyczące tego, co zrobić dalej:

Pomoc

Zasoby pomocowe i wsparcie społeczności znajdziesz na stronie pomocy.

Ankieta

Zanim przejdziesz dalej, poświęć chwilę na wypełnienie ankiety dotyczącej kursu! Twoja opinia pomaga nam ulepszać materiały szkoleniowe dla wszystkich.

Wypełnij ankietę