Przejdź do treści

Szkolenie Nextflow

  • Kursy do samodzielnej nauki

    Witaj w portalu szkoleń społeczności Nextflow!

    Przerabiaj poniższe kursy we własnym tempie — w naszym środowisku webowym lub swoim własnym. Każdy kurs jest praktyczny i składa się z ćwiczeń zorientowanych na cel, które możesz ukończyć samodzielnie.

    Przeglądaj kursy

  • Wydarzenia szkoleniowe

    Szukasz czegoś więcej niż samodzielnej nauki?

    Znajdź ustrukturyzowane wydarzenia szkoleniowe, wskazówki dotyczące prowadzenia własnych szkoleń oraz naszą licencję open-source i politykę wkładu.

    Zobacz wydarzenia szkoleniowe

Tłumaczenie wspomagane przez AI

To tłumaczenie zostało stworzone przy użyciu sztucznej inteligencji i zweryfikowane przez ludzkich tłumaczy. Zachęcamy do przesyłania opinii i sugestii ulepszeń. Więcej informacji znajdziesz w naszym przewodniku tłumaczenia.

Catalog of Nextflow training courses

  • Dla użytkowników

    Uruchamianie pipeline'ów

    Naucz się uruchamiać istniejące pipeline'y bez pisania kodu.

    Nextflow Run: Uruchamianie pipeline'ów z Nextflow

    Szybkie wprowadzenie do uruchamiania pipeline'ów Nextflow, które nie wymaga znajomości kodu. Obejmuje uruchamianie pipeline'ów, pobieranie wyników, korzystanie z kontenerów oraz podstawową konfigurację wykonania.

    Zobacz szkolenie

    Use nf-core: Znajdowanie i uruchamianie pipeline'ów tworzonych przez społeczność

    Szybkie wprowadzenie do wyszukiwania, uruchamiania i konfigurowania pipeline'ów z projektu społecznościowego nf-core — zaczynając od minimalnego demonstracyjnego pipeline'u, a kończąc na pipeline'ie do analizy produkcyjnej.

    Zobacz szkolenie

    Scale with Seqera: Uruchamianie i monitorowanie pipeline'ów na dużą skalę

    Praktyczne wprowadzenie do uruchamiania i monitorowania pipeline'ów Nextflow za pomocą Seqera Platform — zarówno przez interfejs webowy, jak i wiersz poleceń.

    Zobacz szkolenie

    Zarządzanie wykonaniem

    Naucz się efektywnie zarządzać wykonaniem pipeline'ów.

    Configure Execution: Konfigurowanie zasobów, ponownych prób i profili wykonania

    Praktyczne wprowadzenie do konfigurowania wykonania pipeline'ów Nextflow: dostosowywanie do różnych środowisk obliczeniowych, kontrolowanie przydziału zasobów i ponownych prób oraz przełączanie między predefiniowanymi profilami konfiguracyjnymi.

    Zobacz szkolenie

    Więcej tematów już wkrótce

    W tej sekcji planowane są zagadnienia dotyczące strojenia wydajności, wykonania na HPC/w chmurze i inne. Zagłosuj na to, co chcesz zobaczyć jako następne, w naszej krótkiej ankiecie.

  • Dla deweloperów

    Pisanie pipeline'ów

    Naucz się tworzyć własne pipeline'y Nextflow.

    Hello Nextflow: Tworzenie własnych pipeline'ów od podstaw

    Kurs obejmuje podstawowe komponenty języka Nextflow w stopniu wystarczającym do tworzenia prostych, ale w pełni funkcjonalnych pipeline'ów, a także kluczowe elementy projektowania, rozwijania i konfigurowania pipeline'ów.

    Zobacz szkolenie

    Build with nf-core: Korzystanie z narzędzi i zasad nf-core

    Dla deweloperów Nextflow, którzy chcą nauczyć się tworzyć pipeline'y zgodne z nf-core. Kurs omawia strukturę pipeline'ów nf-core w stopniu wystarczającym do tworzenia prostych, ale w pełni funkcjonalnych pipeline'ów, które korzystają z szablonu nf-core i najlepszych praktyk deweloperskich, a także z istniejących modułów nf-core.

    Zobacz szkolenie

    Side Quests: Zagłęb się w zaawansowane tematy Nextflow

    Zbiór samodzielnych mini-kursów przeznaczonych dla deweloperów Nextflow, którzy chcą poszerzyć swoje horyzonty lub pogłębić umiejętności w konkretnych obszarach. Są ułożone liniowo, ale można je przerabiać w dowolnej kolejności (zależności znajdziesz w opisie każdego mini-kursu).

    Przeglądaj Side Quests

    Nextflow dla nauki

    Naucz się tworzyć pipeline'y Nextflow do konkretnych zastosowań naukowych.

    Genomics: Tworzenie pipeline'u do wywoływania wariantów

    Kurs dla badaczy, którzy chcą nauczyć się tworzyć własne pipeline'y genomiczne — na przykładzie wywoływania wariantów, ilustrującego kluczowe wzorce deweloperskie w Nextflow.

    Zobacz szkolenie

    RNAseq: Tworzenie pipeline'u do przetwarzania bulk RNAseq

    Kurs dla badaczy, którzy chcą nauczyć się tworzyć własne pipeline'y RNAseq — na przykładzie przetwarzania bulk RNAseq, ilustrującego kluczowe wzorce deweloperskie w Nextflow.

    Zobacz szkolenie

    Bioimaging: Uruchamianie i konfigurowanie pipeline'ów do obrazowania

    Kurs dla badaczy, którzy chcą nauczyć się uruchamiać i konfigurować pipeline'y do bioimagingu — na przykładzie nf-core/molkart, ilustrującego kluczowe wzorce użytkowania Nextflow.

    Zobacz szkolenie

Konfiguracja i pomoc