Ana içeriğe geç

Nextflow Eğitimi

  • Kendi kendine öğrenme kursları

    Nextflow topluluk eğitim portalına hoş geldiniz!

    Aşağıdaki kursları kendi hızınızda, web tabanlı ortamımızda veya kendi ortamınızda tamamlayın. Her kurs uygulamalıdır ve bağımsız olarak tamamlayabileceğiniz hedefe yönelik alıştırmalar içerir.

    Kurslara göz atın

  • Eğitim Etkinlikleri

    Kendi kendine öğrenmenin ötesinde bir şey mi arıyorsunuz?

    Yapılandırılmış eğitim etkinliklerini, kendi eğitimlerinizi düzenlemek için rehberleri ve açık kaynak lisansımızla katkı politikamızı bulun.

    Eğitim etkinliklerini görüntüleyin

Yapay Zeka Destekli Çeviri

Bu çeviri yapay zeka kullanılarak oluşturulmuş ve insan çevirmenler tarafından gözden geçirilmiştir. Geri bildirimlerinizi ve iyileştirme önerilerinizi memnuniyetle karşılıyoruz. Daha fazla bilgi için çeviri kılavuzumuza bakın.

Nextflow eğitim kursları kataloğu

  • Kullanıcılar için

    Pipeline'ları çalıştırın

    Herhangi bir kod yazmadan mevcut pipeline'ları çalıştırmayı öğrenin.

    Nextflow Run: Nextflow ile pipeline çalıştırın

    Kod anlamayı gerektirmeyen, Nextflow pipeline'larını çalıştırmaya hızlı bir giriş. Pipeline başlatmayı, çıktıları almayı, konteyner kullanmayı ve temel düzeyde yürütmeyi yapılandırmayı kapsar.

    Eğitimi görüntüleyin

    Use nf-core: Topluluk tarafından denetlenmiş pipeline'ları bulun ve çalıştırın

    nf-core topluluk projesinden pipeline'ları bulmaya, çalıştırmaya ve yapılandırmaya hızlı bir giriş. Minimal bir demo pipeline'dan başlayarak üretim ölçeğinde bir analiz pipeline'ına kadar ilerler.

    Eğitimi görüntüleyin

    Scale with Seqera: Pipeline'ları büyük ölçekte başlatın ve izleyin

    Seqera Platform ile Nextflow pipeline'larını hem web arayüzünden hem de komut satırından başlatmaya ve izlemeye uygulamalı bir giriş.

    Eğitimi görüntüleyin

    Yürütmeyi yönetin

    Pipeline yürütmesini etkin biçimde yönetmeyi öğrenin.

    Configure Execution: Kaynakları, yeniden denemeleri ve yürütme profillerini yapılandırın

    Nextflow pipeline yürütmesini yapılandırmaya uygulamalı bir giriş: farklı hesaplama ortamlarına uyum sağlama, kaynak tahsislerini ve yeniden denemeleri kontrol etme ve önceden tanımlanmış yapılandırma profilleri arasında geçiş yapma.

    Eğitimi görüntüleyin

    Daha fazla konu geliyor

    Performans ayarı, HPC/bulut yürütmesi ve daha fazlası bu bölüm için planlanmaktadır. Bir sonraki konuyu belirlemek için kısa ilgi anketimize oy verin.

  • Geliştiriciler için

    Pipeline yazın

    Kendi Nextflow pipeline'larınızı geliştirmeyi öğrenin.

    Hello Nextflow: Sıfırdan kendi pipeline'larınızı geliştirin

    Bu kurs, basit ama tam işlevli pipeline'lar geliştirmeye yetecek düzeyde Nextflow dilinin temel bileşenlerini; ayrıca pipeline tasarımı, geliştirme ve yapılandırma uygulamalarının kilit unsurlarını kapsar.

    Eğitimi görüntüleyin

    Build with nf-core: nf-core araçlarını ve kurallarını kullanın

    nf-core uyumlu pipeline'lar geliştirmeyi öğrenmek isteyen Nextflow geliştiricileri için. Kurs; nf-core şablonunu ve geliştirme en iyi uygulamalarını kullanan, mevcut nf-core modüllerinden yararlanan, basit ama tam işlevli pipeline'lar geliştirmeye yetecek düzeyde nf-core pipeline'larının yapısını kapsar.

    Eğitimi görüntüleyin

    Side Quests: Gelişmiş Nextflow konularına dalın

    Belirli konularda bilgi ve becerilerini genişletmek ya da derinleştirmek isteyen Nextflow geliştiricileri için tasarlanmış bağımsız mini kurslardan oluşan bir koleksiyon. Doğrusal bir sırayla sunulmakla birlikte herhangi bir sırayla alınabilir (bağımlılıklar için her mini kursun giriş bölümüne bakın).

    Side Quests'e göz atın

    Bilim için Nextflow

    Belirli bilimsel uygulamalar için Nextflow pipeline'ları geliştirmeyi öğrenin.

    Genomics: Varyant çağırma pipeline'ı geliştirin

    Kendi genomik pipeline'larını geliştirmeyi öğrenmek isteyen araştırmacılar için bir kurs. Temel Nextflow geliştirme kalıplarını göstermek amacıyla varyant çağırma kullanım senaryosunu ele alır.

    Eğitimi görüntüleyin

    RNAseq: Toplu RNAseq işleme pipeline'ı geliştirin

    Kendi RNAseq pipeline'larını geliştirmeyi öğrenmek isteyen araştırmacılar için bir kurs. Temel Nextflow geliştirme kalıplarını göstermek amacıyla toplu RNAseq işleme kullanım senaryosunu ele alır.

    Eğitimi görüntüleyin

    Bioimaging: Görüntüleme pipeline'larını çalıştırın ve yapılandırın

    Biyogörüntüleme pipeline'larını çalıştırmayı ve yapılandırmayı öğrenmek isteyen araştırmacılar için bir kurs. Temel Nextflow kullanım kalıplarını göstermek amacıyla nf-core/molkart'ı ele alır.

    Eğitimi görüntüleyin

Kurulum ve Yardım