Salta el contingut

Formació en Nextflow

  • Cursos d'autoservei

    Benvingut/da al portal de formació de la comunitat Nextflow!

    Seguiu els cursos següents al vostre ritme, en el nostre entorn web o en el vostre propi. Cada curs és pràctic, amb exercicis orientats a objectius que podeu completar de manera independent.

    Exploreu els cursos

  • Esdeveniments de formació

    Busqueu alguna cosa més enllà de l'autoservei?

    Trobeu esdeveniments de formació estructurats, orientació per organitzar les vostres pròpies formacions, i la nostra llicència de codi obert i política de contribució.

    Vegeu els esdeveniments de formació

Traducció assistida per IA

Aquesta traducció ha estat creada utilitzant intel·ligència artificial i revisada per traductors humans. Agraïm els vostres comentaris i suggeriments de millora. Consulteu la nostra guia de traducció per a més informació.

Catalog of Nextflow training courses

  • Per a usuaris

    Executar pipelines

    Apreneu a executar pipelines existents sense escriure cap codi.

    Nextflow Run: Executeu pipelines amb Nextflow

    Una introducció ràpida a l'execució de pipelines de Nextflow que no requereix comprendre el codi. Cobreix el llançament de pipelines, la recuperació de sortides, l'ús de contenidors i la configuració de l'execució a un nivell bàsic.

    Veure la formació

    Use nf-core: Trobeu i executeu pipelines curades per la comunitat

    Una introducció ràpida a la cerca, execució i configuració de pipelines del projecte comunitari nf-core, començant amb un pipeline de demostració mínim i escalant fins a un pipeline d'anàlisi a escala de producció.

    Veure la formació

    Scale with Seqera: Llanceu i monitoritzeu pipelines a escala

    Una introducció pràctica al llançament i la monitorització de pipelines de Nextflow amb Seqera Platform, tant des de la interfície web com des de la línia de comandes.

    Veure la formació

    Gestionar l'execució

    Apreneu a gestionar l'execució de pipelines de manera eficaç.

    Configure Execution: Configureu recursos, reintents i perfils d'execució

    Una introducció pràctica a la configuració de l'execució de pipelines de Nextflow: adaptació a diferents entorns de càlcul, control d'assignacions de recursos i reintents, i canvi entre perfils de configuració predefinits.

    Veure la formació

    Més temes properament

    L'ajust del rendiment, l'execució en HPC/cloud i més estan planificats per a aquesta secció. Voteu sobre què cobrir a continuació en la nostra breu enquesta d'interès.

  • Per a desenvolupadors

    Escriure pipelines

    Apreneu a desenvolupar els vostres propis pipelines de Nextflow.

    Hello Nextflow: Desenvolupeu els vostres propis pipelines des de zero

    Aquest curs cobreix els components principals del llenguatge Nextflow amb prou detall per permetre el desenvolupament de pipelines senzills però completament funcionals, a més d'elements clau de disseny, desenvolupament i pràctiques de configuració de pipelines.

    Veure la formació

    Build with nf-core: Utilitzeu les eines i les regles de nf-core

    Per a desenvolupadors de Nextflow que vulguin aprendre a desenvolupar pipelines compatibles amb nf-core. El curs cobreix l'estructura dels pipelines de nf-core amb prou detall per permetre el desenvolupament de pipelines senzills però completament funcionals que aprofiten la plantilla de nf-core i les millors pràctiques de desenvolupament, així com l'ús de mòduls de nf-core existents.

    Veure la formació

    Side Quests: Aprofundiu en temes avançats de Nextflow

    Una col·lecció de mini-cursos independents destinats a desenvolupadors de Nextflow que vulguin ampliar el seu ventall i/o aprofundir les seves habilitats en temes concrets. Es presenten de manera lineal però es poden seguir en qualsevol ordre (vegeu les dependències a la descripció general de cada mini-curs).

    Exploreu els Side Quests

    Nextflow per a la Ciència

    Apreneu a desenvolupar pipelines de Nextflow per a aplicacions científiques específiques.

    Genomics: Desenvolupeu un pipeline de detecció de variants

    Un curs per a investigadors que vulguin aprendre a desenvolupar els seus propis pipelines de genòmica, utilitzant un cas d'ús de detecció de variants per demostrar els patrons essencials de desenvolupament amb Nextflow.

    Veure la formació

    RNAseq: Desenvolupeu un pipeline de processament de RNAseq massiu

    Un curs per a investigadors que vulguin aprendre a desenvolupar els seus propis pipelines de RNAseq, utilitzant un cas d'ús de processament de RNAseq massiu per demostrar els patrons essencials de desenvolupament amb Nextflow.

    Veure la formació

    Bioimaging: Executeu i configureu pipelines d'imatge

    Un curs per a investigadors que vulguin aprendre a executar i configurar pipelines de bioimatge, utilitzant nf-core/molkart per demostrar els patrons essencials d'ús de Nextflow.

    Veure la formació

Configuració i ajuda