Resum del curs¶
Traducció assistida per IA - més informació i suggeriments
Felicitats per completar el curs de formació Scale with Seqera! 🎉
El vostre recorregut¶
Heu començat registrant-vos a Seqera Platform i explorant el Community Showcase, després heu llançat un pipeline de producció, nf-core/rnaseq, des de la interfície web i n'heu monitoritzat l'execució.
A continuació, heu autenticat el CLI tw i heu après a fer-ho tot des del terminal.
Finalment, heu registrat un nou pipeline, nf-core/demo, des de GitHub i l'heu llançat tant des de la interfície web com des del CLI.
Què heu après¶
Ara sou capaços de llançar i monitoritzar pipelines de Nextflow a Seqera Platform, tant si preferiu la interfície web com la línia de comandes.
- Un compte gratuït de Seqera us proporciona un espai de treball personal i accés al Community Showcase.
- Els pipelines afegits a un espai de treball apareixen al Launchpad i es poden llançar amb uns quants clics.
- El CLI
twofereix les mateixes funcionalitats que la interfície web, i és útil per a scripts i automatització. - Qualsevol pipeline allotjat a GitHub amb un
main.nfi unnextflow.configes pot registrar ambtw pipelines add. tw launchaccepta paràmetres mitjançant perfils i--params-file, en lloc d'indicadors individuals.
Habilitats adquirides¶
A través d'aquest curs pràctic, heu après a:
- Registrar-vos a Seqera Platform i explorar el Community Showcase
- Afegir un pipeline a un espai de treball i llançar una execució des de la interfície web
- Monitoritzar l'execució i inspeccionar els detalls i informes a nivell de tasca
- Autenticar i utilitzar el CLI
twper gestionar i llançar pipelines des del terminal - Registrar un pipeline allotjat a GitHub i llançar-lo amb un fitxer de paràmetres
Ara esteu preparats per executar i monitoritzar els vostres propis pipelines a Seqera Platform, a escala.
Propers passos per millorar les vostres habilitats¶
Aquí teniu les nostres principals recomanacions sobre què fer a continuació:
- No us limiteu a executar pipelines, desenvolupeu-los! Apreneu a escriure els vostres propis amb Hello Nextflow o Build with nf-core
- Apliqueu Nextflow a un cas d'ús d'anàlisi científica amb Nextflow for Science
- Exploreu funcionalitats més avançades de Nextflow amb els Side Quests
Obtenir ajuda¶
Per a recursos d'ajuda i suport de la comunitat, consulteu la pàgina d'ajuda.
Enquesta de valoració¶
Abans de continuar, dediqueu un minut a completar l'enquesta del curs! Els vostres comentaris ens ajuden a millorar els materials de formació per a tothom.