Side Questscourse¶
-
Resum del curs
Traducció assistida per IA - més informació i suggeriments
Les Side Quests són mini-cursos de formació independents que aprofundeixen en temes específics de Nextflow.
Cada side quest es pot fer de manera independent, en qualsevol ordre, per desenvolupar les vostres habilitats en les àrees específiques que més importin als vostres projectes. En conjunt, cobreixen les habilitats necessàries per passar de pipelines senzills a workflows preparats per a producció.
-
Informació addicional
Requisits tècnics
Necessitareu un compte de GitHub O una instal·lació local de Nextflow. Consulteu Opcions d'entorn per a més detalls.
Objectius d'aprenentatge
- Configurar un entorn de desenvolupament de Nextflow productiu
- Aplicar patrons avançats de programació per a transformacions de dades complexes
- Gestionar i propagar metadades a través de workflows de múltiples passos
- Dividir i agrupar canals de dades per al processament paral·lel i en sèrie
- Provar workflows de Nextflow amb nf-test
- Composar pipelines complexos a partir de mòduls de workflow reutilitzables amb nom
- Treballar eficientment amb fitxers mitjançant les operacions de fitxers de Nextflow
- Depurar problemes comuns de workflows de manera sistemàtica
- Utilitzar i crear plugins de Nextflow
Públic i prerequisits
- Públic: Aquesta col·lecció està dissenyada per a persones que han completat el curs per a principiants Hello Nextflow i volen aprofundir en temes específics.
- Habilitats: S'assumeix experiència amb la línia de comandes i familiaritat amb els conceptes i eines bàsics de Nextflow.
- Cursos: Cal haver completat Hello Nextflow o equivalent.
Exploreu per tema¶
Si és la primera vegada que feu una de les nostres formacions, comenceu per la pàgina de Primers passos per obtenir una visió general de l'entorn de formació i els materials. En cas contrari, podeu endinsar-vos directament en la quest que més us cridi l'atenció.
| Side Quest | Resum | Temps Estimat |
|---|---|---|
| Eines i Trucs per a Desenvolupadors | ||
| Entorn de Desenvolupament | Configurar un entorn de desenvolupament local de Nextflow productiu | 45 minuts |
| Depuració de Workflows | Identificar i corregir errors habituals en workflows | 1 hora |
| Patrons Essencials de Programació | Tècniques avançades de programació per a reptes habituals en workflows | 90 minuts |
| Aprofundiment en el Flux de Dades | ||
| Processament de Fitxers d'Entrada | Gestió de fitxers, operacions de rutes i organització de sortides | 45 minuts |
| Metadades i Meta Maps | Ús de mapes de metadades per fer el seguiment i propagar informació de mostres | 45 minuts |
| Divisió i Agrupació | Tècniques per dividir i reagrupar canals de dades | 45 minuts |
| Arquitectura Modular en Acció | ||
| Workflows de Workflows | Composar pipelines complexos a partir de mòduls de workflow reutilitzables amb nom | 30 minuts |
| L'Univers Estès de Nextflow | ||
| Proves amb nf-test | Escriure i executar proves per a workflows de Nextflow | 1 hora |
| Desenvolupament de Plugins | Utilitzar i crear plugins de Nextflow | 3 hores |