Salta el contingut

Escala amb Seqeracourse

  • Resum del curs

    Traducció assistida per IA - més informació i suggeriments

    Scale with Seqera és una introducció pràctica per llançar i monitoritzar pipelines de Nextflow amb Seqera Platform.

    Treballant amb exemples pràctics, configurareu l'accés a Seqera Platform, llançareu un pipeline a escala de producció tant des de la interfície web com des de la línia de comandes, i afegireu un nou pipeline al vostre workspace.

    Adquirireu les habilitats i la confiança necessàries per executar i monitoritzar els vostres propis pipelines a Seqera Platform.

  • Informació addicional

    Requisits tècnics

    Necessitareu un compte de GitHub O una instal·lació local de Nextflow. Consulteu Opcions d'entorn per a més detalls.

    Objectius d'aprenentatge
    • Registrar-se a Seqera Platform i explorar el Community Showcase
    • Afegir un pipeline a un workspace i llançar-lo des de la interfície web
    • Autenticar-se i llançar pipelines des de la línia de comandes amb el tw CLI
    • Registrar un pipeline allotjat a GitHub i llançar-lo de les dues maneres
    Públic i prerequisits
    • Audiència: Aquest curs està dissenyat per a persones que volen executar pipelines de Nextflow a escala utilitzant Seqera Platform.
    • Habilitats: Es pressuposa familiaritat amb l'execució de pipelines nf-core des de la línia de comandes.
    • Cursos: Cal haver completat Nextflow Run i Use nf-core, o bé tenir experiència executant pipelines locals i nf-core/rnaseq.

Visió general del curs

Aquest curs és pràctic i es basa en els pipelines que ja heu executat a Use nf-core.

Començareu registrant-vos a Seqera Platform i llançant nf-core/rnaseq, un pipeline a escala de producció, des de la interfície web. Després passareu a l'eina de línia de comandes tw per fer el mateix des d'un terminal, i finalment registrareu un nou pipeline, nf-core/demo, i el llançareu de les dues maneres.

Pla de lliçons

Capítol del curs Resum Durada estimada
Part 1: Llançar pipelines des de la interfície web Configurar l'accés a Seqera Platform i llançar un pipeline a escala de producció des de la interfície web 20 min
Part 2: Llançar pipelines des de la línia de comandes Autenticar el tw CLI, llançar un pipeline desat i registrar un nou pipeline des del CLI 25 min

Al final d'aquest curs, us sentireu còmodes llançant i monitoritzant pipelines de Nextflow a Seqera Platform, tant si preferiu treballar des de la interfície web com des de la línia de comandes.

Esteu preparats per començar el curs?

Comenceu a aprendre