Seqera ile Ölçeklendirmecourse¶

Kurs Özeti

Yapay zeka destekli çeviri - daha fazla bilgi ve iyileştirme önerileri

Seqera ile Ölçeklendirme, Seqera Platform kullanarak Nextflow pipeline'larını başlatmaya ve izlemeye yönelik uygulamalı bir giriş kursudur.

Pratik örnekler üzerinden çalışarak Seqera Platform'a erişim kurabilecek, hem web arayüzünden hem de komut satırından üretim ölçeğinde bir pipeline başlatabilecek ve çalışma alanınıza yeni bir pipeline ekleyebileceksiniz.

Bu kursun sonunda Seqera Platform'da kendi pipeline'larınızı çalıştırma ve izleme konusunda gerekli becerileri ve özgüveni kazanmış olacaksınız.
Ek Bilgiler

Teknik Gereksinimler

Bir GitHub hesabına VEYA yerel bir Nextflow kurulumuna ihtiyacınız olacak. Daha fazla ayrıntı için Ortam seçenekleri sayfasına bakın.
Öğrenme Hedefleri
- Seqera Platform'a kaydolun ve Community Showcase'i keşfedin
- Bir çalışma alanına pipeline ekleyin ve web arayüzünden başlatın
- tw CLI ile kimlik doğrulaması yapın ve pipeline'ları komut satırından başlatın
- GitHub'da barındırılan bir pipeline'ı kaydedin ve her iki yöntemle de başlatın
Hedef Kitle ve Ön Koşullar
- Hedef Kitle: Bu kurs, Seqera Platform kullanarak Nextflow pipeline'larını büyük ölçekte çalıştırmak isteyen öğrenenler için tasarlanmıştır.
- Beceriler: nf-core pipeline'larını komut satırından çalıştırma konusunda temel bilgiye sahip olunduğu varsayılmaktadır.
- Kurslar: Nextflow Run ve Use nf-core kurslarını tamamlamış ya da yerel ve nf-core/rnaseq pipeline'larını çalıştırma konusunda deneyimli olunması gerekmektedir.

Kursa genel bakış¶

Bu kurs uygulamalı bir yapıya sahiptir ve Use nf-core kursunda çalıştırdığınız pipeline'lar üzerine inşa edilmektedir.

Seqera Platform'a kaydolarak ve üretim ölçeğinde bir pipeline olan nf-core/rnaseq'i web arayüzünden başlatarak işe başlayacaksınız. Ardından aynı işlemi bir terminalden gerçekleştirmek için tw komut satırı aracına geçecek ve son olarak yeni bir pipeline olan nf-core/demo'yu kaydedip her iki yöntemle de başlatacaksınız.

Ders planı¶

Kurs bölümü	Özet	Tahmini süre
Bölüm 1: Pipeline'ları web arayüzünden başlatma	Seqera Platform erişimini kurun ve üretim ölçeğinde bir pipeline'ı web arayüzünden başlatın	20 dakika
Bölüm 2: Pipeline'ları komut satırından başlatma	`tw` CLI ile kimlik doğrulaması yapın, kaydedilmiş bir pipeline başlatın ve CLI'dan yeni bir pipeline kaydedin	25 dakika

Bu kursun sonunda, web arayüzünü mi yoksa komut satırını mı tercih ettiğinizden bağımsız olarak Seqera Platform'da Nextflow pipeline'larını başlatma ve izleme konusunda kendinize güveneceksiniz.

Kursa başlamaya hazır mısınız?

Öğrenmeye başlayın