Yan Görevlercourse¶
-
Kurs Özeti
Yapay zeka destekli çeviri - daha fazla bilgi ve iyileştirme önerileri
Yan Görevler, belirli Nextflow konularını daha derinlemesine ele alan bağımsız eğitim mini kurslarıdır.
Her yan görev, kendi projeleriniz için en önemli alanlarda becerilerinizi geliştirmek amacıyla herhangi bir sırada bağımsız olarak tamamlanabilir. Bir arada ele alındığında, basit pipeline'lardan üretime hazır iş akışlarına geçmek için ihtiyaç duyduğunuz becerileri kapsarlar.
-
Ek Bilgiler
Teknik Gereksinimler
Bir GitHub hesabına VEYA yerel bir Nextflow kurulumuna ihtiyacınız olacak. Daha fazla ayrıntı için Ortam seçenekleri sayfasına bakın.
Öğrenme Hedefleri
- Üretken bir Nextflow geliştirme ortamı kurun ve yapılandırın
- Karmaşık veri dönüşümleri için gelişmiş betik kalıpları uygulayın
- Çok adımlı iş akışlarında üst veriyi yönetin ve iletin
- Paralel ve sıralı işleme için veri kanallarını bölün ve gruplandırın
- nf-test kullanarak Nextflow iş akışlarını test edin
- Yeniden kullanılabilir adlandırılmış iş akışı modüllerinden karmaşık pipeline'lar oluşturun
- Nextflow dosya işlemleri kullanarak dosyalarla verimli çalışın
- Yaygın iş akışı sorunlarını sistematik olarak hata ayıklayın
- Nextflow plugin'lerini kullanın ve geliştirin
Hedef Kitle ve Ön Koşullar
- Hedef Kitle: Bu koleksiyon, Hello Nextflow başlangıç kursunu tamamlamış ve belirli konulara daha derinlemesine inmek isteyen öğrenenler için tasarlanmıştır.
- Beceriler: Komut satırı deneyimi ve temel Nextflow kavramları ile araçlarına aşinalık varsayılmaktadır.
- Kurslar: Hello Nextflow veya eşdeğerini tamamlamış olmanız gerekmektedir.
Konuya Göre Göz Atın¶
Eğitimlerimizden birini ilk kez alıyorsanız, eğitim ortamına ve materyallerine genel bir bakış için Başlarken sayfasıyla başlayın. Aksi takdirde, sizi çeken herhangi bir göreve doğrudan dalabilirsiniz.
| Yan Görev | Özet | Tahmini Süre |
|---|---|---|
| Geliştirici Araçları & İpuçları | ||
| Geliştirme Ortamı | Üretken bir yerel Nextflow geliştirme ortamı kurun ve yapılandırın | 45 dakika |
| İş Akışı Sorunlarını Giderme | Yaygın iş akışı hatalarını tespit etme ve düzeltme | 1 saat |
| Temel Betik Kalıpları | Yaygın iş akışı zorlukları için gelişmiş betik teknikleri | 90 dakika |
| Veri Akışına Derinlemesine Bakış | ||
| Dosya Girdisi İşleme | Dosya yönetimi, yol işlemleri ve çıktıların düzenlenmesi | 45 dakika |
| Üst Veri ve Meta Map'ler | Örnek bilgilerini izlemek ve iletmek için üst veri map'lerinin kullanımı | 45 dakika |
| Bölme ve Gruplama | Veri kanallarını bölme ve yeniden gruplama teknikleri | 45 dakika |
| Modüler Mimarinin Uygulamada Kullanımı | ||
| İş Akışlarının İş Akışları | Yeniden kullanılabilir adlandırılmış iş akışı modüllerinden karmaşık pipeline'lar oluşturma | 30 dakika |
| Nextflow Genişletilmiş Evreni | ||
| nf-test ile Test Etme | Nextflow iş akışları için test yazma ve çalıştırma | 1 saat |
| Plugin Geliştirme | Nextflow plugin'lerini kullanma ve geliştirme | 3 saat |