Kurs Özeti¶
Yapay zeka destekli çeviri - daha fazla bilgi ve iyileştirme önerileri
Scale with Seqera eğitim kursunu tamamladığınız için tebrikler! 🎉
Yolculuğunuz¶
Seqera Platform'a kaydolarak ve Community Showcase'i keşfederek başladınız; ardından web arayüzünden üretim ölçeğinde bir pipeline olan nf-core/rnaseq'i başlatıp çalışmasını izlediniz.
Sonra tw CLI'ı kimlik doğrulamasından geçirdiniz ve her şeyi terminalden yapmayı öğrendiniz.
Son olarak, GitHub'dan yeni bir pipeline olan nf-core/demo'yu kaydettiniz ve hem web arayüzünden hem de CLI üzerinden başlattınız.
Öğrendikleriniz¶
Artık web arayüzünü ya da komut satırını tercih etmenizden bağımsız olarak Seqera Platform'da Nextflow pipeline'larını başlatabilir ve izleyebilirsiniz.
- Ücretsiz bir Seqera hesabı size kişisel bir çalışma alanı ve Community Showcase'e erişim sağlar.
- Bir çalışma alanına eklenen pipeline'lar Launchpad'de görünür ve birkaç tıklamayla başlatılabilir.
twCLI, web arayüzüyle aynı işlevleri sunar; betik yazma ve otomasyon için oldukça kullanışlıdır.main.nfvenextflow.configdosyalarına sahip GitHub'da barındırılan her pipeline,tw pipelines addkomutuyla kaydedilebilir.tw launch, parametreleri tek tek bayraklar yerine profiller ve--params-filearacılığıyla alır.
Kazanılan Beceriler¶
Bu uygulamalı kurs sayesinde aşağıdakileri yapmayı öğrendiniz:
- Seqera Platform'a kaydolmak ve Community Showcase'i keşfetmek
- Bir çalışma alanına pipeline eklemek ve web arayüzünden çalıştırma başlatmak
- Çalışmayı izlemek, görev düzeyindeki ayrıntıları ve raporları incelemek
twCLI'ı kimlik doğrulamasından geçirmek ve terminalden pipeline'ları yönetip başlatmak- GitHub'da barındırılan bir pipeline'ı kaydetmek ve parametre dosyasıyla başlatmak
Artık Seqera Platform'da kendi pipeline'larınızı ölçekli biçimde çalıştırmaya ve izlemeye hazırsınız.
Becerilerinizi Geliştirmek İçin Sonraki Adımlar¶
Bundan sonra ne yapabileceğinize dair en iyi önerilerimiz:
- Yalnızca pipeline çalıştırmakla kalmayın, geliştirin de! Hello Nextflow veya Build with nf-core ile kendi pipeline'larınızı yazmayı öğrenin.
- Nextflow for Science ile Nextflow'u bilimsel bir analiz kullanım senaryosuna uygulayın.
- Side Quests ile daha gelişmiş Nextflow özelliklerini keşfedin.
Yardım Alma¶
Yardım kaynakları ve topluluk desteği için Yardım sayfasına bakın.
Geri Bildirim Anketi¶
Devam etmeden önce lütfen bir dakikanızı ayırarak kurs anketini doldurun! Geri bildiriminiz, eğitim materyallerimizi herkes için daha iyi hale getirmemize yardımcı olur.