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Kursübersicht

KI-gestützte Übersetzung - mehr erfahren & Verbesserungen vorschlagen

Herzlichen Glückwunsch zum Abschluss des Kurses „Scale with Seqera"! 🎉

Deine Reise

Du hast dich bei Seqera Platform angemeldet und die Community Showcase erkundet, dann eine produktionsreife Pipeline, nf-core/rnaseq, über die Weboberfläche gestartet und ihre Ausführung überwacht. Anschließend hast du die tw CLI authentifiziert und gelernt, alles vom Terminal aus zu erledigen. Zum Schluss hast du eine neue Pipeline, nf-core/demo, von GitHub registriert und sie sowohl über die Weboberfläche als auch über die CLI gestartet.

Was du gelernt hast

Du kannst jetzt Nextflow-Pipelines auf Seqera Platform starten und überwachen – egal ob du die Weboberfläche oder die Kommandozeile bevorzugst.

  • Ein kostenloses Seqera-Konto gibt dir einen persönlichen Workspace und Zugang zur Community Showcase.
  • Pipelines, die einem Workspace hinzugefügt wurden, erscheinen im Launchpad und können mit wenigen Klicks gestartet werden.
  • Die tw CLI bietet dieselben Funktionen wie die Weboberfläche und ist nützlich für Scripting und Automatisierung.
  • Jede auf GitHub gehostete Pipeline mit einer main.nf und nextflow.config kann mit tw pipelines add registriert werden.
  • tw launch nimmt Parameter über Profile und --params-file entgegen, nicht über einzelne Flags.

Erworbene Fähigkeiten

In diesem praxisorientierten Kurs hast du gelernt, wie du:

  • dich bei Seqera Platform anmeldest und die Community Showcase erkundest
  • eine Pipeline zu einem Workspace hinzufügst und einen Run über die Weboberfläche startest
  • die Ausführung überwachst und Details sowie Berichte auf Aufgabenebene einsehen kannst
  • die tw CLI authentifizierst und verwendest, um Pipelines vom Terminal aus zu verwalten und zu starten
  • eine auf GitHub gehostete Pipeline registrierst und mit einer Parameterdatei startest

Du bist jetzt bereit, deine eigenen Pipelines auf Seqera Platform in großem Maßstab auszuführen und zu überwachen.

Nächste Schritte zur Weiterentwicklung

Hier sind unsere wichtigsten Empfehlungen für das weitere Vorgehen:

Hilfe erhalten

Hilferessourcen und Community-Support findest du auf der Hilfeseite.

Feedback-Umfrage

Bevor du weitermachst, nimm dir bitte eine Minute Zeit, um die Kursumfrage auszufüllen! Dein Feedback hilft uns, unsere Trainingsmaterialien für alle zu verbessern.

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