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Kurszusammenfassung

KI-gestützte Übersetzung - mehr erfahren & Verbesserungen vorschlagen

Herzlichen Glückwunsch zum Abschluss des Configure Execution-Kurses! 🎉

Deine Reise

Du hast damit begonnen, die Ausführung einer Pipeline an verschiedene Rechenumgebungen anzupassen: Software-Packaging-Technologien zu wechseln und eine Ausführungsplattform auszuwählen. Danach hast du gelernt, Ressourcenzuweisungen zu steuern und fehlgeschlagene Aufgaben automatisch neu zu starten. Schließlich hast du gelernt, wie du Konfigurationen in Profile bündelst, sie zur Laufzeit kombinierst und die vollständig aufgelöste Konfiguration überprüfst.

Erworbene Fähigkeiten

In diesem praxisorientierten Kurs hast du gelernt, wie du:

  • Zwischen Docker und Conda als Software-Packaging-Technologie wechselst
  • Eine Ausführungsplattform auswählst und verstehst, was dabei im Hintergrund passiert
  • Ressourcenzuweisungen pro Prozess steuerst und fehlgeschlagene Aufgaben automatisch neu startest
  • Profile definierst und kombinierst sowie die aufgelöste Konfiguration mit nextflow config überprüfst

Du bist jetzt in der Lage, Nextflow-Pipelines sicher für verschiedene Rechenumgebungen zu konfigurieren.

Nächste Schritte

Hier sind unsere Top-Empfehlungen für deine nächsten Schritte:

  • Lerne, nf-core-Community-Pipelines auszuführen mit Use nf-core
  • Starte und überwache Pipelines in großem Maßstab mit Scale with Seqera
  • Nicht nur ausführen, sondern auch schreiben! Werde Nextflow-Entwickler*in mit Hello Nextflow
  • Wende Nextflow auf einen wissenschaftlichen Anwendungsfall an mit Nextflow for Science

Hilfe erhalten

Hilferessourcen und Community-Support findest du auf der Hilfeseite.

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